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Inventaire des sources manuscrites de l’histoire d’Alsace conservées dans les bibliothèques publiques de France, Paris, Fédération des sociétés d’histoire et d’archéologie d'Alsace, 1956.
Le Château-Fort dans la vie médiévale : Le Château-Fort et la Politique territoriale, Strasbourg, Centre d'Archéologie médiévale, 1968.
L’Église et la Vie Religieuse en Occident à la fin du Moyen Âge, Paris, PUF, coll. « Nouvelle Clio », 1971. (ISBN978-2130505396)
Réformes et Réformation à Strasbourg. Église et Société dans le diocèse de Strasbourg (1450-1525), Paris, Ophrys, 1974.
Grandes Figures de l’humanisme alsacien. Courants, milieux, destins , Strasbourg, Istra, 1978.
Histoire de Strasbourg des origines à nos jours , 9 vols, Strasbourg, Dernières nouvelles de Strasbourg, 1981.
Les Origines médiévales de l’Allemagne moderne. De Charles IV à Charles Quint (1346-1519), Paris, Aubier, 1989. (ISBN978-2700722246)
Histoire des diocèses de France :Le Diocèse de Strasbourg, Paris, Éditions Beauchesne, 1997.
Koenigsbruck : l’histoire d’une abbaye cistercienne (avec Claude Muller), Strasbourg, Société d’histoire et d’archéologie du Ried Nord, 1998.
↑Jean-Marie Cauchies, « Rapp (Francis). Les origines médiévales de l'Allemagne moderne. De Charles IV à Charles Quint (1346-1519) », Revue belge de philologie et d'histoire, vol. 73, no 2, , p. 488-491 (lire en ligne).